Grafiky Milana Bauera vznikají převážně technikou leptu, ale i dalšími hlubotiskovými technikami. Možnost je zhlédnout měli milovníci umění jak doma, tak i v zahraničí. Jeho ex-libris jsou ozdobou soukromých sbírek i muzeí. Obdržel několik cen, např. cenu poroty na Trienale grafiky ve francouzském Chameliéres (2017) nebo čestné uznání na světovém kongresu FISAE v Praze za kolekci ex libris v roce 2018.

Kromě tvorby grafických listů se Milan Bauer věnuje grafickému designu, grafické úpravě knih a časopisu Vítaný host. Vytváří poštovní známky pro Českou republiku. V roce 2020 získal cenu za třetí nejkrásnější známku na světové výstavě Nexofil v Madridu.